Leczenie zapalenia zatok zależy od jego przyczyny i nasilenia objawów. W przypadkach łagodnego zapalenia wirusowego, leczenie ma charakter przede wszystkim objawowy – zaleca się stosowanie środków udrażniających nos, takich jak roztwory soli fizjologicznej, oraz leków przeciwzapalnych i przeciwbólowych, jak ibuprofen czy paracetamol.

W sytuacji, gdy dolegliwości utrzymują się dłużej niż 7-10 dni lub są nasilone, można rozważyć zastosowanie antybiotyków, szczególnie w przypadku podejrzenia bakteryjnego zapalenia zatok. Decyzję o ich użyciu powinien podjąć lekarz, na podstawie badania klinicznego i ewentualnych badań dodatkowych.

Inne metody terapeutyczne obejmują stosowanie kortykosteroidów donosowych, które pomagają zmniejszyć obrzęk błony śluzowej i ułatwić drenaż zatok. W przypadku przewlekłego zapalenia zatok, które nie reaguje na standardowe metody leczenia, może być konieczne leczenie chirurgiczne, mające na celu przywrócenie prawidłowego drenażu i wentylacji zatok.

Zaleca się również stosowanie inhalacji parą wodną, ciepłych okładów na twarz, oraz odpowiednie nawodnienie organizmu, które wspomagają proces leczenia i łagodzenia objawów zapalenia zatok.